独自のCSSを設置してデザインを自由に変更することができますか？

はい！可能です。

自分で作成したCSS（スタイルシート）を、利用しているテーマのデザインに反映させることは可能です。

独自CSSの設置方法

独自のCSSを設定するためには、jetpackプラグインを有効にする必要があります。

まずは、jetpackを有効にしてください。

jetpackを有効には、WordPress.com との連携（アカウント）が必要です。

連携方法はリンク先の説明を参照してください。

連携が完了したら、jetpackの設定画面にあるCustom CSSを有効化してください。

以上で利用するまでの準備はできました。

有効後、管理画面のメニューから外観＞CSS編集から、オリジナルのCSSを追加・設定することが可能です。